| **標章** | ||
| 1998.09.23 | 第一屆國家醫藥品質銀質獎 | 品保部（現為醫品部） |
| 2013.12.19 | 運用優質E化平台整合全方位之護理照護系統認證 | 護理部 |
| 2013.12.19 | 南投縣仁愛鄉山地醫療整合性照護計畫 | 社區暨長照醫學部（現社醫部） |
| 2013.12.19 | 為愛多走一里路 - 外展式的兒童發展評估」 | 兒發中心（現為心理健康中心） |
| 2014.12.18 | 偏鄉地區老人與兒童社會工作處遇 | 社服室（現為社工室） |
| 2014.12.18 | 愛在懷恩-專業與人文關懷的社區型養護機構 | 懷恩 |
| 2014.12.18 | 日月潭觀光地區急診醫療資源整合照護 | 社區暨長照醫學部（現社醫部） |
| 2016.12.23 | 在地老化、尊嚴善終、圓滿人生照顧的家榮獲國家生技醫療品質獎「銀獎」 | 埔基護理之家 |
| 2016.12.23 | 運用優質E化平台整合全方位之個人健康管理系統認證 | 護理部 |
| 2017.12.08 | 一步一腳印 - 復健守護你 | 復健科 |
| 2017.12.08 | 在地善終，讓生命旅程畫下完美句點 | 安寧居家 |
| 2018.11.30 | 偏鄉檢驗整合服務 - 在需要的地方，看到我們的責任 | 檢驗科 |
| 2022.05.02 | 社區長照整體照顧 - 長樂共創、幸福照顧 | 長照中心 |
| **認證** | ||
| 1998.08.03 | 通過ISO 9002認證，本院品質口號「親切、效率、專業、喜樂」 | 品保部（現為醫品部） |
| 1999.01.14 | ISO9002：1994 國際品質管理系統認證 | 品保部（現為醫品部） |
| 2007.01 | 法國貝爾國際驗證機構ISO/IWA1︰2005認證 | 醫品部 |
| 2007.08.14 | 艾法諾(AFNOR ASIA)國際單位驗證(OHSAS18001:2007) | 環工室附屬勞工安全單位（現職安室） |
| 2009.12.10 | 資訊安全管理系統（UKAS英國皇家認證委員會）ISO 27001及全國認證基金會（TAF）雙認證 | 資訊室 |
| 2011.01.01 | 通過TAF ISO15189醫學領域實驗室認證 | 檢驗科 |
| 2011.11.01 | 衛生福利部餐飲業食品安全管制系統(HACCP)認證 | 營養科 |
| 2011.11.11 | ISO 9000:2000/IWA1認證(2011/11~2014/3) | 醫品部 |
| 2019.11.30 | HACCP（餐飲業食品安全管制系統）認證 | 營養科 |
| 2024.01.01 | HACCP（餐飲業食品安全管制系統）認證，最大安全生產量：2500餐/日。 | 營養科 |