各單位初始者
人力資源室主任／李旭麗
| 埔基董事會一覽表 | |||||
| 職稱 | 年 | 任期 | 服事期間 | 主管 | 備註 |
| 董事長 | 1978 | 首屆 | 1978-12-03~1985-04-01 | 廖懷義 | |
| 董事長 | 1985 | 第一屆 | 1985-06-01~1988-05-31 | 吳震春 | 第一任 |
| 董事長 | 1988 | 第二屆 | 1988-06-01~1991-05-31 | 吳震春 | 第一任 |
| 董事長 | 1991 | 第三屆 | 1991-06-01~1994-05-31 | 吳震春 | 第一任 |
| 董事長 | 1994 | 第四屆 | 1994-06-01~1997-05-31 | 潘俊雄 | 第二任 |
| 董事長 | 1997 | 第五屆 | 1997-06-01~2000-05-31 | 潘俊雄 | 第二任 |
| 董事長 | 2000 | 第六屆 | 2000-06-01~2003-05-31 | 潘俊雄 | 第二任 |
| 董事長 | 2003 | 第七屆 | 2003-06-01~2006-05-31 | 潘俊雄 | 第二任 |
| 董事長 | 2006 | 第八屆 | 2006-06-01~2009-05-31 | 潘俊雄 | 第二任 |
| 董事長 | 2009 | 第九屆 | 2009-06-01~2012-05-31 | 林國川 | 第三任 |
| 董事長 | 2012 | 第十屆 | 2012-06-01~2015-05-31 | 黃敏生 | 第四任 |
| 董事長 | 2015 | 第十一屆 | 2015-06-01~2018-05-31 | 黃敏生 | 第四任 |
| 董事長 | 2018 | 第十二屆 | 2018-06-01~2021-05-31 | 黃敏生 | 第四任 |
| 董事長 | 2021 | 第十三屆 | 2021-06-01~2024-05-31 | 趙文崇 | 第四任 |
| 董事長 | 2024 | 第十四屆 | 2024-06-01~迄 今 | 趙文崇 | 第四任 |
| 埔基院長室一覽表 | |||||
| 職稱 | 年 | 任期 | 服事期間 | 主管 | 備註 |
| 台灣芥菜種會創辦人 | 1948 | 1948~1959 | 孫理蓮 | ||
| 院長 | 1955 | 第一任 | 1955-10~1970-02 | 謝 緯 | |
| 院長 | 1970 | 第二任 | 1970-02~1985-07 | 徐賓諾 | |
| 院長 | 1985 | 第三任 | 1985-07~1991-06 | 紀歐惠 | |
| 院長 | 1991 | 第四任 | 1991-07~1994-07 | 吳文勇 | |
| 院長 | 1994 | 第五任 | 1994-08~2003-06 | 黃 蔚 | |
| 院長 | 2003 | 第六任 | 2003-07~2012-06 | 趙文崇 | 特助： 滕春祐、侯宏彬 |
| 院長 | 2012 | 第七任 | 2012-07~2018-06 | 陳恒常 | 特助： 侯宏彬、滕春祐 |
| 院長 | 2018 | 第八任 | 2018-07~迄 今 | 2018-07~迄 今 | 特助： 王森洤、滕春祐 |
| 埔基行政副院長室一覽表 | |||||
| 職稱 | 年 | 任期 | 服事期間 | 主管 | 備註 |
| 總務主任 | 1956 | 1956-10~1975-12 | 賴誼照 | 芥菜種會聘任 | |
| 行政副院長 | 1978 | 第一任 | 1976~1983 | 高紀剛 | 登報應徵 |
| 行政副院長 | 1985 | 第二任 | 1985-07~1995 | 成 亮 | 董事會聘任 |
| 行政副院長 | 1995 | 第三任 | 1995-08~2000-06 | 林麗雪 | 董事會聘任 |
| 行政副院長 | 2000 | 第四任 | 2000-07~2012-09 | 劉建志 | 董事會聘任 |
| 代理行政副院長 | 2012 | 2012-10-01~2013-04-01 | 侯宏彬 | 董事會聘任 | |
| 行政副院長 | 2013 | 第五任 | 2013-04-01~迄今 | 侯宏彬 | 董事會聘任 |
| 埔基宣教部一覽表 |
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| 職稱 | 年 | 任期 | 服事期間 | 主管 | 備註 |
| 牧師 | 1958 | 1958~1960 |
謝進講 |
台中中會山地部派 |
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| 院牧部主任 |
1981 | 第一任 | 1981~1987 |
藍榮德 |
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| 代理院牧部主任 | 1997 | 1997~2001 |
林麗琴 |
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| 院牧部主任 | 2001 | 第二任 |
2001~2005 |
蔡三雄 |
董事會聘任 |
| 宣教部主任 | 2005 | 第三任 |
2005~2012 |
蕭錦鋒 |
董事會聘任 |
| 代理宣教部主任 | 2015 | 2015~2016 |
賴棟祺 |
2011年1月1日更名為宣教部 |
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| 代理宣教部主任 | 2016 | 2016~2019 |
林惠敏 |
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| 宣教部主任 | 2019 | 第三任 | 2019~2025 | 蕭錦鋒 | 董事會聘任 |
| 宣教部主任 | 2025 | 第四任 | 2025~迄今 | 潘忠一 | |
| 埔基護理部一覽表 | |||||
| 職稱 | 年 | 任期 | 服事期間 | 主管 | 備註 |
| 護理主任(中心診所) | 1958 | 第一任 | 1958~1960 | 林雪貞 | |
| 護理主任 | 1960 | 第二任 | 1960~1965 | 林保華 | |
| 護理部主任 | 1965 | 第三任 | 1965~1973 | 譚凱莉 | |
| 護理部主任 | 1973 | 第四任 | 1973~1977 | 莫美華 | |
| 護理部主任 | 1997 | 第五任 | 1977~1981 | 劉恩美 | |
| 護理部主任 | 1981 | 第六任 | 1981~1997 | 廖婌園 | |
| 護理部主任 | 1997 | 第七任 | 1997~1999 2000~2003 |
謝秀華 | |
| 代理護理部主任 | 1999 | 1999~2000 | 鄭學敏 | ||
| 護理部主任 | 2003 | 第八任 | 2003-08~迄今 | 廖靜珠 | |
| 埔基醫務副院長室一覽表 | |||||
| 職稱 | 年 | 任期 | 服事期間 | 主管 | 備註 |
| 埔基行政部（行政管理部）一覽表 | |||||
| 職稱 | 年 | 任期 | 服事期間 | 主管 | 備註 |
| 行政管理部主任 | 1994 | 第一任 | 1994-08~2000-06 | 林麗雪 | |
| 管理部主任 | 2000 | 第二任 | 2000-07~2001-03 | 劉建志 | |
| 管理部主任 | 2001 | 第三任 | 2001-03~2001-07 | 房樹梅 | |
| 管理部主任 | 2001 | 第四任 | 2001-08~2003-12 | 林文堂 | |
| 管理處主任 | 2004 | 第五任 | 2004-01~2005-03 | 劉建志 | |
| 管理處主任 | 2005 | 第六任 | 2005-04~2013-03 | 侯宏彬 | |
| 管理處主任 | 2013 | 第七任 | 2013-04~2015-08 | 房樹梅 | |
| 管理處主任 | 2015 | 第八任 | 2015-09~2015-12 | 侯宏彬 | (兼) |
| 行政部主任 | 2016 | 第九任 | 2016-01~迄今 | 侯宏彬 | (兼) |
| 埔基醫務部一覽表 | |||||
| 職稱 | 年 | 任期 | 服事期間 | 主管 | 備註 |
| 醫務部主任 | 1997 | 第一任 | 1997-07-05~1999-03-21 | 朱炤廉 | |
| 醫務部主任 | 1999 | 第二任 | 1999-03-22~2015-12-31 | 陳錦康 | |
| 醫務部主任 | 2016 | 第三任 | 2016-01~2016-12 | 謝志松 | |
| 醫務部主任 | 2017 | 第四任 | 2017-01~2017-06 | 陳錦康 | |
| 醫務部主任 | 2017 | 第五任 | 2017-07~2018-06 | 蘇世強 | (兼) |
| 醫務部主任 | 2018 | 第六任 | 2018-07~2021-06 | 熊立楷 | |
| 醫務部主任 | 2021 | 第七任 | 2021-07~迄今 | 謝旭滿 | |
| 埔基醫療品質部一覽表 | |||||
| 職稱 | 年 | 任期 | 服事期間 | 主管 | 備註 |
| 品保部主任 | 1998 | 第一任 | 1998-01~2005-03 | 廖婌園 | |
| 醫療品質部主任 | 2005 | 第二任 | 2005-03~2007-03 | 林麗雪 | |
| 醫療品質部主任 | 2007 | 第三任 | 2007-03~2010 | 李智貴 | |
| 醫療品質部主任 | 2011 | 第四任 | 2011-01~2011-12 | 趙文崇 | 品質組、評鑑組 |
| 醫療品質部主任 | 2012 | 第五任 | 2012-01~2012-06 | 柯德鑫 | 品質組、評鑑組 |
| 醫療品質部主任 | 2012 | 第六任 | 2012-07~2013-03 | 陳錦康 | 品質組(含病人安全)、評鑑組 |
| 醫療品質部主任 | 2013 | 第七任 | 2013-04~2017-06 | 陳恒常 | 品質組、評鑑組 |
| 醫療品質部主任 | 2016 | 第八任 | 2017-07~2019-12 | 蘇世強 | (兼) |
| 醫療品質部主任 | 2020 | 第九任 | 2020~迄今 | 游玉緣 | 品質組、病安組、評鑑組 |
| 埔基社區醫學部一覽表 | |||||
| 職稱 | 年 | 任期 | 服事期間 | 主管 | 備註 |
| 家醫科主任 | 1999 | 第一任 | 1999~2000 | 李智貴 | 含社區醫療 |
| 社區健康部主任 | 2000 | 2000~2006 | 李智貴 | ||
| 社區醫學部主任 | 2006 | 2006~2010 | 李智貴 | ||
| 社區暨長照醫學部主任 | 2011 | 第二任 | 2011-01~2015-04 | 陳錦康 | |
| 社區暨長照醫學部主任 | 2015 | 第三任 | 2015-05~2016-07 | 詹弘廷 | |
| 社區醫學部主任 | 2016 | 第四任 | 2016-08~2019-11 | 陳恒順 | (兼) |
| 社區醫學部主任 | 2019 | 第五任 | 2019-11-20~2024-10-31 | 沈錳碩 | |
| 社區醫學部主任 | 2024 | 第六任 | 2024-11-01~迄今 | 陳恒順 | (兼) |
| 埔基醫事部（醫學技術部）一覽表 | |||||
| 職稱 | 年 | 任期 | 服事期間 | 主管 | 備註 |
| 醫學技術部主任 | 2001 | 第一任 | 2001~2006 | 吳文勇 | |
| 醫學技術部主任 | 2007 | 第二任 | 2007~2010 | 詹益豐 | |
| 醫事部主任 | 2011 | 2011~2017 | 詹益豐 | ||
| 醫事部主任 | 2018 | 第三任 | 2018~2025 | 張常勝 | |
| 醫事部主任 | 2025 | 第四任 | 2025~迄今 | 謝旭滿 | (兼) |